forked from zibraproject/zika-pipeline
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 67
/
nCoV-2019.bed
218 lines (218 loc) · 11.7 KB
/
nCoV-2019.bed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
MN908947.3 30 54 nCoV-2019_1_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 385 410 nCoV-2019_1_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 320 342 nCoV-2019_2_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 704 726 nCoV-2019_2_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 642 664 nCoV-2019_3_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 1004 1028 nCoV-2019_3_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 943 965 nCoV-2019_4_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 1312 1337 nCoV-2019_4_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 1242 1264 nCoV-2019_5_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 1623 1651 nCoV-2019_5_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 1573 1595 nCoV-2019_6_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 1942 1964 nCoV-2019_6_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 1875 1897 nCoV-2019_7_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 1868 1890 nCoV-2019_7_LEFT_alt0 nCoV-2019_1 +
MN908947.3 2247 2269 nCoV-2019_7_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 2242 2264 nCoV-2019_7_RIGHT_alt5 nCoV-2019_1 -
MN908947.3 2181 2205 nCoV-2019_8_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 2568 2592 nCoV-2019_8_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 2505 2529 nCoV-2019_9_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 2504 2528 nCoV-2019_9_LEFT_alt4 nCoV-2019_1 +
MN908947.3 2882 2904 nCoV-2019_9_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 2880 2902 nCoV-2019_9_RIGHT_alt2 nCoV-2019_1 -
MN908947.3 2826 2850 nCoV-2019_10_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 3183 3210 nCoV-2019_10_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 3144 3166 nCoV-2019_11_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 3507 3531 nCoV-2019_11_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 3460 3482 nCoV-2019_12_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 3826 3853 nCoV-2019_12_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 3771 3795 nCoV-2019_13_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 4142 4164 nCoV-2019_13_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 4054 4077 nCoV-2019_14_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 4044 4068 nCoV-2019_14_LEFT_alt4 nCoV-2019_2 +
MN908947.3 4428 4450 nCoV-2019_14_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 4402 4424 nCoV-2019_14_RIGHT_alt2 nCoV-2019_2 -
MN908947.3 4294 4321 nCoV-2019_15_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 4296 4322 nCoV-2019_15_LEFT_alt1 nCoV-2019_1 +
MN908947.3 4674 4696 nCoV-2019_15_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 4666 4689 nCoV-2019_15_RIGHT_alt3 nCoV-2019_1 -
MN908947.3 4636 4658 nCoV-2019_16_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 4995 5017 nCoV-2019_16_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 4939 4966 nCoV-2019_17_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 5296 5321 nCoV-2019_17_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 5230 5259 nCoV-2019_18_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 5257 5287 nCoV-2019_18_LEFT_alt2 nCoV-2019_2 +
MN908947.3 5620 5644 nCoV-2019_18_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 5620 5643 nCoV-2019_18_RIGHT_alt1 nCoV-2019_2 -
MN908947.3 5563 5586 nCoV-2019_19_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 5932 5957 nCoV-2019_19_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 5867 5894 nCoV-2019_20_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 6247 6272 nCoV-2019_20_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 6167 6196 nCoV-2019_21_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 6168 6197 nCoV-2019_21_LEFT_alt2 nCoV-2019_1 +
MN908947.3 6528 6550 nCoV-2019_21_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 6526 6548 nCoV-2019_21_RIGHT_alt0 nCoV-2019_1 -
MN908947.3 6466 6495 nCoV-2019_22_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 6846 6873 nCoV-2019_22_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 6718 6745 nCoV-2019_23_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 7092 7117 nCoV-2019_23_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 7035 7058 nCoV-2019_24_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 7389 7415 nCoV-2019_24_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 7305 7332 nCoV-2019_25_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 7671 7694 nCoV-2019_25_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 7626 7651 nCoV-2019_26_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 7997 8019 nCoV-2019_26_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 7943 7968 nCoV-2019_27_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 8319 8341 nCoV-2019_27_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 8249 8275 nCoV-2019_28_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 8635 8661 nCoV-2019_28_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 8595 8619 nCoV-2019_29_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 8954 8983 nCoV-2019_29_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 8888 8913 nCoV-2019_30_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 9245 9271 nCoV-2019_30_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 9204 9226 nCoV-2019_31_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 9557 9585 nCoV-2019_31_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 9477 9502 nCoV-2019_32_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 9834 9858 nCoV-2019_32_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 9784 9806 nCoV-2019_33_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 10146 10171 nCoV-2019_33_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 10076 10099 nCoV-2019_34_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 10437 10459 nCoV-2019_34_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 10362 10384 nCoV-2019_35_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 10737 10763 nCoV-2019_35_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 10666 10688 nCoV-2019_36_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 11048 11074 nCoV-2019_36_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 10999 11022 nCoV-2019_37_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 11372 11394 nCoV-2019_37_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 11306 11331 nCoV-2019_38_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 11668 11693 nCoV-2019_38_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 11555 11584 nCoV-2019_39_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 11927 11949 nCoV-2019_39_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 11863 11889 nCoV-2019_40_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 12234 12256 nCoV-2019_40_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 12110 12133 nCoV-2019_41_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 12465 12490 nCoV-2019_41_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 12417 12439 nCoV-2019_42_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 12779 12802 nCoV-2019_42_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 12710 12732 nCoV-2019_43_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 13074 13096 nCoV-2019_43_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 13005 13027 nCoV-2019_44_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 13007 13029 nCoV-2019_44_LEFT_alt3 nCoV-2019_2 +
MN908947.3 13378 13400 nCoV-2019_44_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 13363 13385 nCoV-2019_44_RIGHT_alt0 nCoV-2019_2 -
MN908947.3 13319 13344 nCoV-2019_45_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 13307 13336 nCoV-2019_45_LEFT_alt2 nCoV-2019_1 +
MN908947.3 13669 13699 nCoV-2019_45_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 13660 13689 nCoV-2019_45_RIGHT_alt7 nCoV-2019_1 -
MN908947.3 13599 13621 nCoV-2019_46_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 13602 13625 nCoV-2019_46_LEFT_alt1 nCoV-2019_2 +
MN908947.3 13962 13984 nCoV-2019_46_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 13961 13984 nCoV-2019_46_RIGHT_alt2 nCoV-2019_2 -
MN908947.3 13918 13946 nCoV-2019_47_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 14271 14299 nCoV-2019_47_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 14207 14232 nCoV-2019_48_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 14579 14601 nCoV-2019_48_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 14545 14570 nCoV-2019_49_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 14898 14926 nCoV-2019_49_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 14865 14895 nCoV-2019_50_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 15224 15246 nCoV-2019_50_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 15171 15193 nCoV-2019_51_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 15538 15560 nCoV-2019_51_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 15481 15503 nCoV-2019_52_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 15861 15886 nCoV-2019_52_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 15827 15851 nCoV-2019_53_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 16186 16209 nCoV-2019_53_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 16118 16144 nCoV-2019_54_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 16485 16510 nCoV-2019_54_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 16416 16444 nCoV-2019_55_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 16804 16833 nCoV-2019_55_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 16748 16770 nCoV-2019_56_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 17130 17152 nCoV-2019_56_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 17065 17087 nCoV-2019_57_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 17430 17452 nCoV-2019_57_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 17381 17406 nCoV-2019_58_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 17738 17761 nCoV-2019_58_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 17674 17697 nCoV-2019_59_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 18036 18062 nCoV-2019_59_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 17966 17993 nCoV-2019_60_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 18324 18348 nCoV-2019_60_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 18253 18275 nCoV-2019_61_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 18650 18672 nCoV-2019_61_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 18596 18618 nCoV-2019_62_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 18957 18979 nCoV-2019_62_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 18896 18918 nCoV-2019_63_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 19275 19297 nCoV-2019_63_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 19204 19232 nCoV-2019_64_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 19591 19616 nCoV-2019_64_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 19548 19570 nCoV-2019_65_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 19911 19939 nCoV-2019_65_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 19844 19866 nCoV-2019_66_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 20231 20255 nCoV-2019_66_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 20172 20200 nCoV-2019_67_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 20542 20572 nCoV-2019_67_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 20472 20496 nCoV-2019_68_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 20867 20890 nCoV-2019_68_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 20786 20813 nCoV-2019_69_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 21146 21169 nCoV-2019_69_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 21075 21104 nCoV-2019_70_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 21427 21455 nCoV-2019_70_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 21357 21386 nCoV-2019_71_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 21716 21743 nCoV-2019_71_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 21658 21682 nCoV-2019_72_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 22013 22038 nCoV-2019_72_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 21961 21990 nCoV-2019_73_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 22324 22346 nCoV-2019_73_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 22262 22290 nCoV-2019_74_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 22626 22650 nCoV-2019_74_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 22516 22542 nCoV-2019_75_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 22877 22903 nCoV-2019_75_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 22797 22819 nCoV-2019_76_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 22798 22821 nCoV-2019_76_LEFT_alt3 nCoV-2019_2 +
MN908947.3 23192 23214 nCoV-2019_76_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 23189 23212 nCoV-2019_76_RIGHT_alt0 nCoV-2019_2 -
MN908947.3 23122 23144 nCoV-2019_77_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 23500 23522 nCoV-2019_77_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 23443 23466 nCoV-2019_78_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 23822 23847 nCoV-2019_78_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 23789 23812 nCoV-2019_79_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 24145 24169 nCoV-2019_79_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 24078 24100 nCoV-2019_80_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 24443 24467 nCoV-2019_80_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 24391 24416 nCoV-2019_81_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 24765 24789 nCoV-2019_81_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 24696 24721 nCoV-2019_82_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 25052 25076 nCoV-2019_82_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 24978 25003 nCoV-2019_83_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 25347 25369 nCoV-2019_83_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 25279 25301 nCoV-2019_84_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 25646 25673 nCoV-2019_84_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 25601 25623 nCoV-2019_85_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 25969 25994 nCoV-2019_85_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 25902 25924 nCoV-2019_86_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 26290 26315 nCoV-2019_86_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 26197 26219 nCoV-2019_87_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 26566 26590 nCoV-2019_87_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 26520 26542 nCoV-2019_88_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 26890 26913 nCoV-2019_88_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 26835 26857 nCoV-2019_89_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 26838 26860 nCoV-2019_89_LEFT_alt2 nCoV-2019_1 +
MN908947.3 27202 27227 nCoV-2019_89_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 27190 27215 nCoV-2019_89_RIGHT_alt4 nCoV-2019_1 -
MN908947.3 27141 27164 nCoV-2019_90_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 27511 27533 nCoV-2019_90_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 27446 27471 nCoV-2019_91_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 27825 27854 nCoV-2019_91_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 27784 27808 nCoV-2019_92_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 28145 28172 nCoV-2019_92_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 28081 28104 nCoV-2019_93_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 28442 28464 nCoV-2019_93_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 28394 28416 nCoV-2019_94_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 28756 28779 nCoV-2019_94_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 28677 28699 nCoV-2019_95_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 29041 29063 nCoV-2019_95_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 28985 29007 nCoV-2019_96_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 29356 29378 nCoV-2019_96_RIGHT nCoV-2019_2 -
MN908947.3 29288 29316 nCoV-2019_97_LEFT nCoV-2019_1 +
MN908947.3 29665 29693 nCoV-2019_97_RIGHT nCoV-2019_1 -
MN908947.3 29486 29510 nCoV-2019_98_LEFT nCoV-2019_2 +
MN908947.3 29836 29866 nCoV-2019_98_RIGHT nCoV-2019_2 -