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[Hackathon 6th Code Camp No.15] support neuraloperator docs #917
[Hackathon 6th Code Camp No.15] support neuraloperator docs #917
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…/PaddleScience into add_neuraloperator
… into add_neuraloperator
…/PaddleScience into add_neuraloperator
…/PaddleScience into add_neuraloperator
…/PaddleScience into add_neuraloperator
…/PaddleScience into add_neuraloperator
…/PaddleScience into add_neuraloperator
Thanks for your contribution! |
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
| [sfno 模型]() | 1.01075 | 2.33481 | | ||
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## 1. 背景简介 | ||
许多科学和工程问题涉及反复求解复杂的偏微分方程 (PDE) 系统,以获取某些参数的不同值。例如分子动力学、微力学和湍流流动。通常这样的系统需要精细的离散化才能捕捉所模拟的现象。因此,传统数值求解器速度慢,有时效率低下。机器学习方法可能通过提供快速的求解器来革新科学领域,这些求解器可以近似或增强传统求解器。然而,经典神经网络在有限维空间之间进行映射,因此只能学习与特定离散化相关的解决方案。这通常是实际应用中的一个限制,因此需要开发与网格无关的神经网络。最近,一项新的工作提出了用神经网络学习无网格、无限维算子。神经算子通过产生一组用于不同离散化、且与网格无关的参数,来弥补有限维算子方法中网格依赖性的问题。 neuraloperator 通过直接在傅里叶空间 (Fourier space) 中参数化 (parameterize) 积分核 (integral kernel) 来制定一个新的神经算子,从而实现了富有表现力和高效的架构。论文对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验。傅里叶神经算子是第一个基于机器学习的方法,成功地用零样本超分辨率模拟湍流。与传统 PDE 求解器相比,它快达三个数量级。 |
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多加了一个空格
许多科学和工程问题涉及反复求解复杂的偏微分方程 (PDE) 系统,以获取某些参数的不同值。例如分子动力学、微力学和湍流流动。通常这样的系统需要精细的离散化才能捕捉所模拟的现象。因此,传统数值求解器速度慢,有时效率低下。机器学习方法可能通过提供快速的求解器来革新科学领域,这些求解器可以近似或增强传统求解器。然而,经典神经网络在有限维空间之间进行映射,因此只能学习与特定离散化相关的解决方案。这通常是实际应用中的一个限制,因此需要开发与网格无关的神经网络。最近,一项新的工作提出了用神经网络学习无网格、无限维算子。神经算子通过产生一组用于不同离散化、且与网格无关的参数,来弥补有限维算子方法中网格依赖性的问题。 neuraloperator 通过直接在傅里叶空间 (Fourier space) 中参数化 (parameterize) 积分核 (integral kernel) 来制定一个新的神经算子,从而实现了富有表现力和高效的架构。论文对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验。傅里叶神经算子是第一个基于机器学习的方法,成功地用零样本超分辨率模拟湍流。与传统 PDE 求解器相比,它快达三个数量级。 | |
许多科学和工程问题涉及反复求解复杂的偏微分方程 (PDE) 系统,以获取某些参数的不同值。例如分子动力学、微力学和湍流流动。通常这样的系统需要精细的离散化才能捕捉所模拟的现象。因此,传统数值求解器速度慢,有时效率低下。机器学习方法可能通过提供快速的求解器来革新科学领域,这些求解器可以近似或增强传统求解器。然而,经典神经网络在有限维空间之间进行映射,因此只能学习与特定离散化相关的解决方案。这通常是实际应用中的一个限制,因此需要开发与网格无关的神经网络。最近,一项新的工作提出了用神经网络学习无网格、无限维算子。神经算子通过产生一组用于不同离散化、且与网格无关的参数,来弥补有限维算子方法中网格依赖性的问题。 neuraloperator 通过直接在傅里叶空间 (Fourier space) 中参数化 (parameterize) 积分核 (integral kernel) 来制定一个新的神经算子,从而实现了富有表现力和高效的架构。论文对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验。傅里叶神经算子是第一个基于机器学习的方法,成功地用零样本超分辨率模拟湍流。与传统 PDE 求解器相比,它快达三个数量级。 |
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
许多科学和工程问题涉及反复求解复杂的偏微分方程 (PDE) 系统,以获取某些参数的不同值。例如分子动力学、微力学和湍流流动。通常这样的系统需要精细的离散化才能捕捉所模拟的现象。因此,传统数值求解器速度慢,有时效率低下。机器学习方法可能通过提供快速的求解器来革新科学领域,这些求解器可以近似或增强传统求解器。然而,经典神经网络在有限维空间之间进行映射,因此只能学习与特定离散化相关的解决方案。这通常是实际应用中的一个限制,因此需要开发与网格无关的神经网络。最近,一项新的工作提出了用神经网络学习无网格、无限维算子。神经算子通过产生一组用于不同离散化、且与网格无关的参数,来弥补有限维算子方法中网格依赖性的问题。 neuraloperator 通过直接在傅里叶空间 (Fourier space) 中参数化 (parameterize) 积分核 (integral kernel) 来制定一个新的神经算子,从而实现了富有表现力和高效的架构。论文对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验。傅里叶神经算子是第一个基于机器学习的方法,成功地用零样本超分辨率模拟湍流。与传统 PDE 求解器相比,它快达三个数量级。 | ||
## 2. 模型原理 | ||
本章节仅对 NeuralOperator 的模型原理进行简单地介绍,详细的理论推导请阅读 | ||
[Fourier Neural Operator for Parametric Partial Differential Equations](https://arxiv.org/abs/2010.08895)。 |
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这里不要换行
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
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| 模型 | 32x64_l2 | 64x128_l2 | | ||
| :-- | :-- | :-- | | ||
| [sfno 模型]() | 1.01075 | 2.33481 | |
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更新模型和数据集下载链接,更新完之后三个模型的训练、推理、导出等流程跑一遍,保证使用上述提供的命令能够完成该案例。
模型:
sfno模型:https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/neuraloperator/neuraloperator_sfno.pdparams
tfno模型:https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/neuraloperator/neuraloperator_tfno.pdparams
uno模型:https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/neuraloperator/neuraloperator_uno.pdparams
数据集:
darcy_flow:
https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_test_16.npy
https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_test_32.npy
https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_train_16.npy
swe:
https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/test_SWE_32x64.npy
https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/test_SWE_64x128.npy
https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/train_SWE_32x64.npy
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
模型的总体结构如图所示: | ||
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<figure markdown> | ||
![NeuralOperator-arch](https://github.com/PaddlePaddle/PaddleScience/assets/71805205/299b9244-fbb6-4bdd-ab9b-a017034b2ef9){ loading=lazy style="margin:0 auto"} |
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docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
模型预训练阶段是基于随机初始化的网络权重对模型进行训练,如下图所示,其中 $X_[w,h]$ 表示大小为 $w*h$ 的二维偏微分数据,$Y_[w,h]$ 表示预测的大小为 $w*h$ 的二维偏微分方程数值解,$Y_{true[w,h]}$ 表示真实二维偏微分方程数值解。最后网络模型预测的输出和真值计算 LpLoss 或者 H1 损失函数。 | ||
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<figure markdown> | ||
![FNO-pretraining](https://github.com/PaddlePaddle/PaddleScience/assets/71805205/ae66f124-04cb-4b5d-b45a-c916cc4f22b7){ loading=lazy style="margin:0 auto;height:70%;width:70%"} |
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docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
在推理阶段,给定大小为 $w*h$ 的二维偏微分数据,预测得到大小为 $w*h$ 的二维偏微分方程数值解。 | ||
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<figure markdown> | ||
![FNO-infer](https://github.com/PaddlePaddle/PaddleScience/assets/71805205/21b67b89-d87a-4dda-a354-91606f73296a){ loading=lazy style="margin:0 auto;height:60%;width:60%"} |
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docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
k(x) 的黑色区域就是可以渗透的地方,白色为不可渗透的区域。右侧是目标结果,颜色越亮,压力越大。 | ||
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<figure markdown> | ||
![TFNO-predict](https://github.com/PaddlePaddle/PaddleScience/assets/71805205/d0c07ef6-cad3-4db2-8e03-fbd62458f740){ loading=lazy style="margin:0 auto;height:100%;width:100%"} |
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docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
下图展示了 UNO 对 Darcy-flow 数据的预测结果和真值结果。 | ||
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<figure markdown> | ||
![UNO-predict](https://github.com/PaddlePaddle/PaddleScience/assets/71805205/8088aaf5-3479-4dde-b498-6ce123c10b4f){ loading=lazy style="margin:0 auto;height:100%;width:100%"} |
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docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
下图展示了 SFNO 对 SWE 数据的预测结果和真值结果。 | ||
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<figure markdown> | ||
![SFNO-predict](https://github.com/PaddlePaddle/PaddleScience/assets/71805205/a80b004a-009f-43e4-bb0f-919e1d9de4e5){ loading=lazy style="margin:0 auto;height:100%;width:100%"} |
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图片也上传了,更新后预览看一下,保证图片大小合适
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=== "模型训练命令" | ||
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``` sh |
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训练数据集的下载辛苦按照这个格式命令下载。
# linux
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/DeepONet/antiderivative_unaligned_train.npz
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/DeepONet/antiderivative_unaligned_test.npz
# windows
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/deeponet/antiderivative_unaligned_train.npz -o antiderivative_unaligned_train.npz
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/deeponet/antiderivative_unaligned_test.npz -o antiderivative_unaligned_test.npz
python deeponet.py
python examples/neuraloperator/train_tfno.py mode=eval | ||
# uno 模型评估 | ||
python examples/neuraloperator/train_uno.py mode=eval | ||
``` |
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模型评估辛苦按照下面的格式下载数据集和模型权重,将模型权重放到EVAL.pretrained_model_path参数下
# linux
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/DeepONet/antiderivative_unaligned_train.npz
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/DeepONet/antiderivative_unaligned_test.npz
# windows
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/deeponet/antiderivative_unaligned_train.npz -o antiderivative_unaligned_train.npz
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/deeponet/antiderivative_unaligned_test.npz -o antiderivative_unaligned_test.npz
python deeponet.py mode=eval EVAL.pretrained_model_path=https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/deeponet/deeponet_pretrained.pdparams
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
| [sfno 模型](https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/neuraloperator/neuraloperator_sfno.pdparams) | 1.01075 | 2.33481 | | ||
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## 1. 背景简介 | ||
许多科学和工程问题涉及反复求解复杂的偏微分方程 (PDE) 系统,以获取某些参数的不同值。例如分子动力学、微力学和湍流流动。通常这样的系统需要精细的离散化才能捕捉所模拟的现象。因此,传统数值求解器速度慢,有时效率低下。机器学习方法可能通过提供快速的求解器来革新科学领域,这些求解器可以近似或增强传统求解器。然而,经典神经网络在有限维空间之间进行映射,因此只能学习与特定离散化相关的解决方案。这通常是实际应用中的一个限制,因此需要开发与网格无关的神经网络。最近,一项新的工作提出了用神经网络学习无网格、无限维算子。神经算子通过产生一组用于不同离散化、且与网格无关的参数,来弥补有限维算子方法中网格依赖性的问题。 Neuraloperator 通过直接在傅里叶空间 (Fourier space) 中参数化 (parameterize) 积分核 (integral kernel) 来制定一个新的神经算子,从而实现了富有表现力和高效的架构。论文对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验。傅里叶神经算子是第一个基于机器学习的方法,成功地用零样本超分辨率模拟湍流。与传统 PDE 求解器相比,它快达三个数量级。 |
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许多科学和工程问题涉及反复求解复杂的偏微分方程 (PDE) 系统,以获取某些参数的不同值。例如分子动力学、微力学和湍流流动。通常这样的系统需要精细的离散化才能捕捉所模拟的现象。因此,传统数值求解器速度慢,有时效率低下。机器学习方法可能通过提供快速的求解器来革新科学领域,这些求解器可以近似或增强传统求解器。然而,经典神经网络在有限维空间之间进行映射,因此只能学习与特定离散化相关的解决方案。这通常是实际应用中的一个限制,因此需要开发与网格无关的神经网络。最近,一项新的工作提出了用神经网络学习无网格、无限维算子。神经算子通过产生一组用于不同离散化、且与网格无关的参数,来弥补有限维算子方法中网格依赖性的问题。 Neuraloperator 通过直接在傅里叶空间 (Fourier space) 中参数化 (parameterize) 积分核 (integral kernel) 来制定一个新的神经算子,从而实现了富有表现力和高效的架构。论文对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验。傅里叶神经算子是第一个基于机器学习的方法,成功地用零样本超分辨率模拟湍流。与传统 PDE 求解器相比,它快达三个数量级。 | |
许多科学和工程问题,如分子动力学、微力学和湍流流动,都需要反复求解复杂的偏微分方程(PDE)系统,以便获取某些参数的不同值。为了准确捕捉所模拟的现象,这些系统通常需要进行精细的离散化。然而,这也导致了传统数值求解器运行缓慢,有时甚至效率低下。在这种情况下,机器学习方法有望通过提供快速求解器来革新科学领域,这些求解器能够近似或增强传统方法。但值得注意的是,经典神经网络是在有限维空间之间进行映射,因此它们只能学习与特定离散化相关的解决方案,这在实际应用中是一个限制。为了克服这一限制,最近的一项新研究提出了使用神经网络来学习无网格、无限维的算子。这种神经算子通过生成一组用于不同离散化且与网格无关的参数,解决了有限维算子方法中的网格依赖性问题。该研究通过直接在傅里叶空间中参数化积分核,制定了一个新的神经算子,从而创建了一个富有表现力和高效的架构。论文中对 Burgers 方程、Darcy 流和 Navier-Stokes 方程进行了实验验证。值得一提的是,傅里叶神经算子作为首个基于机器学习的方法,成功地以零样本超分辨率模拟了湍流,其速度比传统PDE求解器快达三个数量级。 |
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
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### 2.1 模型训练、推理过程 | ||
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模型预训练阶段是基于随机初始化的网络权重对模型进行训练,如下图所示,其中 $X_[w,h]$ 表示大小为 $w*h$ 的二维偏微分数据,$Y_[w,h]$ 表示预测的大小为 $w*h$ 的二维偏微分方程数值解,$Y_{true[w,h]}$ 表示真实二维偏微分方程数值解。最后网络模型预测的输出和真值计算 LpLoss 或者 H1 损失函数。 |
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模型预训练阶段是基于随机初始化的网络权重对模型进行训练,如下图所示,其中 $X_[w,h]$ 表示大小为 $w*h$ 的二维偏微分数据,$Y_[w,h]$ 表示预测的大小为 $w*h$ 的二维偏微分方程数值解,$Y_{true[w,h]}$ 表示真实二维偏微分方程数值解。最后网络模型预测的输出和真值计算 LpLoss 或者 H1 损失函数。 | |
模型预训练阶段是基于随机初始化的网络权重对模型进行训练,如下图所示,其中 $X_{[w,h]}$ 表示大小为 $w*h$ 的二维偏微分数据,$Y_{[w,h]}$ 表示预测的大小为 $w*h$ 的二维偏微分方程数值解,$Y_{true[w,h]}$ 表示真实二维偏微分方程数值解。最后网络模型预测的输出和真值计算 LpLoss 或者 H1 损失函数。 |
… into add_neuraloperator
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
``` sh | ||
# darcy-flow 数据集下载 | ||
# linux | ||
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_train_16.npy |
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保证用户下载完成数据后能够直接运行代码,按照config配置添加数据保存路径
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_train_16.npy | |
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_train_16.npy -P ./datasets/darcyflow/ |
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
# uno 模型训练 | ||
python examples/neuraloperator/train_uno.py | ||
|
||
# SEVIR 数据集下载 |
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SWE 数据集下载
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_test_32.npy -o darcy_test_32.npy | ||
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_test_16.npy -o darcy_test_16.npy | ||
# tfno 模型训练 | ||
python examples/neuraloperator/train_tfno.py |
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默认用户在neuraloperator目录下,因此 python train_tfno.py 即可。其他运行命令也修改下
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
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# SEVIR 数据集下载 | ||
# linux | ||
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/train_SWE_32x64.npy |
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wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/train_SWE_32x64.npy | |
wget -nc https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/train_SWE_32x64.npy -P ./datasets/SWE/ |
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/SWE_data/test_SWE_32x64.npy -o test_SWE_32x64.npy | ||
|
||
# sfno 模型训练 | ||
python examples/neuraloperator/train_sfno.py |
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sfno模型训练报错,请检查一下。paddle develop版本
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docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_test_32.npy -o darcy_test_32.npy | ||
# curl https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/datasets/neuraloperator/darcy_flow/darcy_test_16.npy -o darcy_test_16.npy | ||
# tfno 模型评估 | ||
python examples/neuraloperator/train_tfno.py mode=eval EVAL.pretrained_model_path=https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/neuraloperator/neuraloperator_tfno.pdparams |
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把 examples/neuraloperator/ 去掉吧,其他的命令也类似改下
… into add_neuraloperator
…/PaddleScience into add_neuraloperator
docs/zh/examples/neuraloperator.md
Outdated
# uno 模型评估 | ||
python train_uno.py mode=eval EVAL.pretrained_model_path=https://paddle-org.bj.bcebos.com/paddlescience/models/neuraloperator/neuraloperator_uno.pdparams | ||
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# SEVIR 数据集下载 |
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SWE
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LGTM
…ddle#917) * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc * move-paddle-harmonics * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-docs * add-neuraloperator-docs * add-neuraloperator-docs * add-neuraloperator-doc * add-neuraloperator-doc
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